Dr. Ramune là một bộ anime kể về những căn bệnh bí ẩn, dường như con người không thể tìm hiểu ra được nguyên nhân gây bệnh cũng như việc chữa được căn bệnh quái ác này, tuy nhiên khi mà chỉ cần trái tim tồn tại bên trong con người, sẽ luôn có những người đau khổ. Và sau đó một thứ gì đó “lạ” xâm nhập vào tâm trí họ và gây ra một căn bệnh lạ biểu hiện trong cơ thể khiến cho cơ thể chết dần chết mòn. Và cũng chính căn bệnh này, được gọi là “căn bệnh bí ẩn” hầu hết chưa được biết đến, nhưng chắc chắn có tồn tại. Trong thời điểm đó có một bác sĩ và người học việc chiến đấu với căn bệnh mà y học hiện đại không thể chữa khỏi, anh ta luôn tự tìm hiểu cũng như cố gắng tìm ra phương pháp chữa bệnh.
Tên anh ấy là Ramune, anh cũng chính là nhân vật chính trong bộ anime này. Trong cuộc hành trình tìm hiểu về căn bệnh này thì Ramune luôn hành động tự do mọi lúc, mồm mép và thậm chí không giống một bác sĩ một chút nào, vì anh ta nhìn khá là cổ quái so với những bác sĩ khác! Tuy nhiên, một khi phải đối mặt với căn bệnh bí ẩn, anh ta có thể nhanh chóng khám phá ra nguyên nhân sâu xa khiến bệnh nhân của mình gặp nạn và cứu chữa họ. Và hơn thế nữa … anh muốn tự mình tìm ra phương thuốc hiệu quả rất để chữa bệnh một cách đơn giản nhất cho những bệnh nhân anh gặp. Tuy nhiên trong cuộc hành trình đó nó lại không hề dễ dàng một chút nào, anh luôn phải đối phó với rất nhiều việc xung quanh.