Là một trong những bộ phim được khán giả yêu thích nhất của ATV trong những năm 2000, Khử Tà Diệt Ma phần 3 nối tiếp thành công của 2 phần trước để viết lên đoạn kết cho seri rất ăn khách của nhà đài Hong Kong này. Bộ đôi ăn ý bậc nhất của ATV là Doãn Thiên Chiếu và Vặn Ỷ Văn vẫn là những trụ cột của phần cuối này, trong khi phim cũng có thêm những gương mặt mới như Trần Triển Bằng, Ngô Đình Diệp.
Nối tiếp phần 2, Khử Tà Diệt Ma phần 3 bắt đầu từ lúc Mã Tiểu Linh và Phương Thiên Hữu đã cùng hi sinh trong trận chiến với Tướng Thần. Tuy nhiên, phép màu đã đến khi 2 người họ sống lại ở một thế giới vĩnh hằng có tên Bàn Cổ. Trong khi, Dao Trì Thánh Mẫu và Nhậm Hi từng là một đôi tình nhân trong quá khứ nhưng lúc này họ đã chia tay. Dao Trì đe dọa sẽ phá hủy cả thế giới để ép buộc Nhậm Hi quay lại với ả, nhưng Nhậm Hi không còn yêu Dao Trì và anh chỉ muốn ở bên người yêu mới của mình là Chang’e. Khi này, Dao Trì Thánh Mẫu bắt đầu ghen tị với tình yêu của họ và ả ta dự định sẽ phá hủy thế giới cho thỏa lòng.
Trong khi đó, Phương Thiên Hữu và Mã Tiểu Linh đang tận hưởng cuộc sống mới và hạnh phúc của họ trong thế giới thiên đường của Bàn Cổ. Tuy nhiên, họ bất ngờ bị cuốn vào cuộc xung đột giữa Dao Trì và Nhậm Hi, kết quả là Phương Thiên Hữu bị trọng thương khi Dao Trì Thánh Mẫu giới thiệu một loại virus chết người để quét sạch mọi sự sống trên thiên đường.