Câu chuyện trong phim Super Cub xoay quanh về một nữ sinh có tên là Koguma, bản thân cô gái này là một học sinh trung học năm hai dè dặt, không có gì cả, không có cha mẹ, sở thích, bạn bè hay mục tiêu, vì thế mà cuộc sống của Koguma dường như rất vô vị và không có bất kì niềm vui gì, chính vì thế mà cô luôn trở thành một con người sống độc lập với thế giới xung quanh. Vào một ngày nọ khi đang trên đường về nhà vào một buổi chiều, cô ghé vào một cửa hàng bán xe với hy vọng mua được một chiếc xe tay ga. Chỉ có đủ tiền để trang trải cuộc sống, cô cảm thấy chán nản trước những mức giá quá cao và chuẩn bị quay trở lại.
Tuy nhiên, khi cô chuẩn bị rời đi, chủ cửa hàng đưa cho cô một chiếc Honda Super Cub đã qua sử dụng với giá 10.000 yên. Tin rằng chiếc xe máy sẽ giúp làm bừng sáng thế giới đơn điệu của cô ấy, cô ấy chấp nhận thỏa thuận và quyết định chốt đơn ngay chiếc xe máy này. Khi Koguma đi khắp thị trấn của mình trong những cuộc phiêu lưu nhỏ với chiếc Super Cub của mình, cô ấy bắt đầu xây dựng tình bạn không thể thay thế và háo hức tiến tới cuộc sống mới của mình. Cũng kể từ khi có chiếc xe máy Honda Super Cub thì cũng là lúc mà cuộc sống của Koguma bước sang một trang mới, cô bắt đầu có những niềm vui mới giành cho mình, có bạn bè và những người quan tâm đến mình.